Echipa de fotbal Universitatea Craiova a fost înființată în anul 1948 sub denumirea U.N.S.R. Craiova, fiind legată de prima instituție de învățământ universitar din oraș, Institutul de Mașini și Aparate Electrice. Aceasta a luat naștere sub egida Ministerului Învățământului Public și a Uniunii Naționale a Studenților din România (U.N.S.R.), cu scopul de a promova sportul universitar.
Primul meci din istoria clubului Universitatea Craiova s-a disputat pe 5 septembrie 1948, împotriva echipei C.F.R. Filiași. Această partidă amicală, desfășurată pe terenul sportiv din Filiași, s-a încheiat cu victoria gazdelor, scor 6-3 (2-1 la pauză).
Presa locală din acea perioadă, ziarul Înainte, nota despre meci:
Pe terenul sportiv din Filiași, a a avut loc Duminică 5 Septembrie a. c. un match de foot-ball intre studenții craioveni și echipa C.F.R. din localitate. Dela început matchul s’a desfășurat sub dominația feroviară care s’au bucurat de o mai bună condiție fizică și pregătire tehnică. Goalurile au fost marcate de Rade (3), Merfu (1), și Mihăilă (2 în propria-i poartă), pentru C. F. R. Filiași, iar pentru studenți au marcat Bădescu și Rădulescu. S’au remarcat în joc: Rada, Ruicu, Udrescoi, Răcășanu și Tobă dela C.F.R., iar dela MSR: Dumitrescu, Rădulescu, Carliș și Ozon. Formațiile: CFR Filiași: Gheorghe V. (Răcăreanu I.), Stoianevici, Tobă, Olar, Bicică, Cricitoru II, Radu, Răcăreanu II, Udrescu, Ruicu, Merțu. MSR: Dumitrescu, Rădulescu (Mihăilă), Carii, Ozon, Mihăilă (Rădulescu), Serbii, Ilie Mora, Bădescu, Tudor și Serghi.
Articolul a fost semnat de Crețu S., un corespondent voluntar.
U.N.S.R. Craiova a susținut primul meci oficial abia la doi ani de la înființare, mai exact în 1950, tot cu echipa Filiașului, în campionatul județean. În 1953, U.N.S.R. Craiova și-a schimbat denumirea în Știința Craiova și, tot atunci, a fost înscrisă la turneul final al Cupei României, în noiembrie 1954, cu ocazia turneului de baraj de la Arad. Știința Craiova, antrenată de Nicolae Oțeleanu, obținea pentru prima dată în istoria clubului, promovarea în Divizia B. Din păcate pentru olteni, echipa retrograda la sfârșitul ediției 1955.
În 1957, pe 7 octombrie, a avut loc prima partidă internațională a Științei Craiova, contra formației Hristo Botev Vrața (Bulgaria), pe care a învins-o cu 4-1. La 6 iulie 1958, pe stadionul „1 Mai“ din Râmnicu Vâlcea, Știința a terminat la egalitate, 1-1, cu Unirea Râmnicu Vâlcea și a revenit în Divizia B. În 1960, a fost inaugurat stadionul „Central“, care, la acea vreme, era cel mai mare stadion din provincie.
La finalul sezonului 1963-1964, Știința a promovat în premieră în Divizia A. Atunci, echipa condusă de pe bancă de același Nicolae Oțeleanu a câștigat clar în ultima etapă, 3-0 cu Metalul Târgoviște, principala contracandidată la promovare. După doi ani în Divizia A, în 1966, Știința Craiova a devenit Universitatea Craiova.